1、整体上而言，生物信息学硕士学位的就业方向主要在这几个方面：医学、生物学、动物学、计算机、健康等。就业领域包括政府研究部门、教育、医疗机构、科研机构等。
2、自然科学经理可以使用生物信息学专业知识向科学家推荐各种分析其特定数据集的方法，通过合作来共同完成一个项目。自然科学经理负责监督科学家的工作，包括化学家，物理学家和生物学家。他们指导与研究和开发相关的活动，并协调测试，质量控制和生产等活动。
3、而一般管理岗位的话，都需要更好的学位，且专业知识不能差，否则无法胜任。因此，生物信息学硕士学位正好足够。该学位2018统计平均薪资$123,860，预计2016-2026就业增长10%，大体数量上其实比计算机科学家增长的还要多。
4、微生物学家要求最低为该领域的学士学位，但拥有生物信息学硕士学位就拥有更高的薪资，更高的发展起点。该职业主要是进行各种研究实验来研究微生物，如细菌、病毒、真菌、寄生虫等。
5、美国劳工局BLS统计表示，该职位平均年薪在$71,650，预计2016-2026就业增长8%，对比整体增长5%，该领域的就业形势还算不错。一般都是在搞基础性研究，主要解决工业生产过程中遇到的问题，并监测环境条件以确保公众健康和安全等等。
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